使用说明
这22个问题覆盖了文献阅读的各个方面，从数据来源到方法学细节， 从模型构建到逻辑分析。在阅读每篇文献时，用这些问题清单作为指导， 可以帮助你全面理解论文的核心内容。
队列数据获取权限
文章中的队列数据是如何获取的，我有权限获取到吗？
样本量/生物学重复
文章中的生物学重复n一般为多少？帮我分Figure或者分实验类型进行总结
GWAS/临床数据总结
帮我详细总结一下文章用到的数据，包括GWAS、临床数据等，人群年龄段、来源、表型或疾病名称等
高通量测序分组
文章进行了哪些高通量测序？如转录组、蛋白质组等，帮我总结对应的分组和样品数
MIMIC数据库SQL
提取文章中的数据，应该如何进行SQL语句的编写？我的MIMIC数据库已经安装到本地了
统计方法与软件
帮我总结文章中用到的统计学方法以及统计软件
动物/细胞模型
文章中用到了那些动物模型和细胞模型？
基因操纵方式
文章中用到的基因操纵方式（敲除小鼠、病毒、质粒、shRNA等），作了哪几种干预？给药方案、长期还是短期干预等
高阶实验技术
文章除了进行PCR、WB这样常规的实验外，还用了那些较为高阶的实验？
代码实现复现
文章的代码实现方法具体是使用了Python吗？使用了哪些依赖库或包？能否就本文案例进行代码复现？
Figure面板分析
帮我列出来各个Figure的小panel都讲述了什么内容，相似的小panel可以合并展示，同时分横纵坐标说明
Figure/Table逻辑关系
文中的各个Figure以及Table之间的逻辑关系是什么？
协变量选择依据
该文章协变量选择的依据是什么？
混合效应模型原因
文章中为什么采用混合效应模型呢？是因为每个人有多个观测吗？文中哪里提到了？
作者来源与分工
文章的作者来源于哪些机构，作者分工是什么？
敏感性分析
阅读文献，指出文章进行的敏感性分析（Sensitive analysis）有哪些？
Cox回归模型确认
文章中提到使用Cox回归模型，这么说，数据中含有死亡状态与死亡时间的数据？这是一个纵向队列？
背景知识阐述
文章是如何对于目前治疗靶点的局限性、背景知识进行阐述的？既往研究的痛点和局限性在哪里呢？
Figure对比分析
Figure 3与Figure1区别就是Figure3调整了协变量、Figure1没有，别的还有啥区别和相似之处吗？
多模态模型代码分析
帮我分析这个仓库，总结作者如何实现多模态模型核心代码，是否包含关键创新点的实现（跨模态注意力、对比学习、缺失数据处理等）
菌群研究方法对比
这几篇文献找到致病菌或者候选菌的思路和方法有什么相同和不同？用的是特定的什么库吗？是用了系统发育树的方法吗？还是使用组学技术进行的检测呢？
机制思路构建
作者是如何锁定到组蛋白修饰这个机制的？涉及到的组蛋白种类是什么？修饰类型是什么？在疾病中发挥了什么作用？
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